Как выплачивается зарплата через зарплатный проект?

Как происходит оплата НДФЛ при выплате зарплаты через зарплатный проект? НДФЛ платится отдельно, и в ведомости уже указывается сумма после вычета НДФЛ и страховых взносов? Или в ведомости нужно указывать полную сумму до вычета?