Налоговый вычет при использовании НДС для ИП на УСН

Здравствуйте.

Подскажите, пожалуйста, насколько велики риски проблем с налоговой в случае, если ИП на УСН выставляет счет с НДС? И в последствии его оплачивает по всем правилам, а также подает декларацию. Насколько я знаю, предприниматели на спецрежимах освобождены от уплаты НДС, но они могут выставлять счета-фактуры с НДС — законом это не запрещено. Но, когда клиент запросит налоговый вычет по этому проекту, то налоговая в ходе проверки имеет право ему отказать на основании, что я, ИП на УСН, не являюсь юрлицом с уплатой НДС. Что наблюдаете на практике?

Спасибо